Los jesuitas fueron los últimos en llegar al virreinato del Perú, desembarcaron en Lima en 1569 y tres años después pasaron a la audiencia de charcas hoy Bolivia y trataron de fundar un colegio para los hijos de Españoles y criollos pero fueron atacados por los gobiernos de Europa porque difundían en dichos colegios que el poder de los reyes emanada del pueblo y no de Dios por lo que fueron expulsados por el presidente de la audiencia de charcas.