Las perspectivas teóricas sobre el proyecto político zapatista atraviesan los temas de la lucha armada, del diálogo con la sociedad civil y del autogobierno de las comunidades indígenas campesinas de Chiapas, de acuerdo con los diferentes momentos de dirección política apuntados por los comunicados oficiales del Ejército Zapatista de Liberación Nacional (EZLN). Este estudio busca debatir la idea de que los autogobiernos de las comunidades zapatistas son el soporte material y simbólico de la estrategia autonómica del movimiento zapatista.
Este es entendido como una amalgama política que involucra a comunidades indígenas y un ejército campesino de autodefensa a una vasta red de simpatizantes nacionales e internacionales como: intelectuales académicos y no académicos blancos, mestizos e indígenas, religiosos, centros de investigación, organizaciones no gubernamentales de defensa de los Derechos Humanos, que desarrollan programas de educación, salud, organización económica y productiva junto a las comunidades.